1−3 ноября 2000 года по благословению Высокопреосвященнейшего митрополита Санкт-Петербургского и Ладожского Владимира в Санкт-Петербурге проходила Церковно-научная конференция «II Свято-Иоанновские Чтения». Ее учредителями и организаторами стали Мемориальный Музей-квартира Святого Праведного Отца Иоанна Кронштадтского и Отдел Религиозного Образования и Духовного Просвещения Санкт-Петербургской Епархии В работе «Чтений» принимали участие священнослужители, ученые, архивисты, педагоги, деятели культуры и искусства, православные миряне и целые приходы из различных стран и регионов Российской Федерации: Эстонии, Санкт-Петербурга, Лен. области, Архангельска, Москвы и Московской области — все, кому дорого имя святого праведного Иоанна Кронштадтского. Торжественное открытие «II Свято-Иоанновских Чтений» совершил митрополит Санкт-Петербургский и Ладожский Владимир. В своем слове он подчеркнул величие подвига отца Иоанна, его актуальность и особую значимость для православной жизни сегодня. Владыка также отметил, что наше время ценно славной возможностью исследовать духовное наследие святого праведного Иоанна Кронштадтского, ибо все еще помнят те годы, когда не только духовный опыт и исторические материалы, но и само имя Дорогого Батюшки было поводом для гонений и поношений. На заседании присутствовал вице-губернатор Санкт-Петербурга В.И.Шитарев, который в своем приветственном слове выразил надежду, что «Свято-Иоанновские Чтения», безусловно, являющиеся событием городской культурной жизни, будут носить регулярный характер, получат официальный статус и будут и в дальнейшем пользоваться поддержкой светских властей. Архимандрит Трифон, настоятель Антониево-Сийского монастыря, поделился опытом проведения подобных Чтений в г. Архангельске. Свои воспоминания поведал собравшимся известный Петербургский протоиерей Иоанн Миронов. Знаменитый драматический актер В.М.Ивченко, давно любимая петербургскими слушателями певица Е. Смольянинова и другие исполнители порадовали собравшихся Праздничным концертом, на котором прозвучали воспоминания об отце Иоанне, а также были впервые исполнены песни на стихи его ближайшей духовной дочери — игумении Таисии Леушинской. К участникам конференции обратились потомки святого праведного Иоанна Кронштадтского Г. В.Шпякина и Т.И.Орнатская. Они поблагодарили всех устроителей и участников «Чтений» за их труды по прославлению имени Кронштадтского Подвижника. Т.И.Орнатская, кроме того, ознакомила присутствовавших с новыми документами по истории взаимоотношений святого Иоанна Кронштадтского с родными и близкими. Всего на трех заседаниях было обсуждено более 20 докладов и сообщений по следующим тематическим разделам: «Духовный подвиг отца Иоанна Кронштадтского» «Иоанн Кронштадтский и русское монашество» «Иоанн Кронштадтский и XX век» «Иоанн Кронштадтский и проблемы современной педагогики» Свои труды представили на суд широкой аудитории сотрудники издательского отдела Санкт-Петербургской епархии, Санкт-Петербургской Духовной Академии, Центрального Государственного Архива (ЦГАОР), Государственного Эрмитажа. Вниманию собравшихся были представлены уникальные исторические и аналитические материалы. Участниками конференции была предпринята попытка рассмотреть роль протоиерея Иоанна Ильича Сергиева-Кронштадтского в духовно-исторических судьбах России духовно осмыслить наследие одного из величайших святых Земли Русской. II Санкт-Петербургские «Свято-Иоанновские Чтения» стали новым этапом в ходе этой важнейшей работы. Паломническая поездка в г. Кронштадт, где более полувека подвизался Великий Молитвенник Земли Русской, и молебен в мемориальной квартире святого Иоанна Кронштадтского стали естественным завершением работы «Чтений» и средоточием благодатных, духовных ценностей, которыми обогатились все их участники. По материалам конференции предполагается подготовить ряд публикаций в ежемесячном журнале «Кронштадтский Пастырь», а также в газете «Леушино». Намечено издание церковно-исторического альманаха «Кронштадтский Пастырь».
