Дело в том, что мы слово "Несть" понимаем как "Нет". На самом деле речь идёт о понятии которое переводится не одним словом, а примерно так: "Нет, Не было и Не будет".
Кстати, в дониконовском Символе веры так и говорится: "... Его же Царствию несть конца..."
Подcтавляем и получаем примерно так:
Не было, нет и не будет власти, которая не от Бога.
Что и трактуется как "нет власти не от Бога".
Хотя я солидарен с теми, кому хотелось бы трактовать иначе.
Но...