Игумен Псково-Печерский был канонизирован как преподобный отец, только в 1955 году, то есть после смерти Сталина и видимо в связи с этим, служба была переписана как преподобномученнику. Об этом писал митрополит Иоанн Снычев.

Хотя митрополит Филипп прославлен как святитель, есть все основания пологать, что он был умершвлён от удушья угарным газом заговорщиками, сведшими его с кафедры, об этом Малюта Скуратов доложил царю Иоанну Грозному, после чего разгневанный царь наложил опалу на всех виновников низложения, более того, именно тогда он подверг массовым казням жителей Новгорода.

Вопреки расхожему мнению, что царь казнил всех новгородцев без разбору, были казнены только знатные роды, виновные в сговоре отложиться от Московии и примкнуть к Речи Посполитой. Об этом говорит тот факт, что основная масса населения Новгорода довольно безучастно взирало на эти казни и не встало на защиту своих сограждан против немногочисленного войска опричников (1,5 тыс). И казнено было не более 3-х тысяч человек.