"почему Господь был в этой войне на стороне Советской России."

А почему Вы так уверены в этом? Вы думаете что Господь Бог по нашему, по человечески, "берет сторону" во всех войнах на этой земле? Потому-что тогда можно сделать и такой вывод - что Господь Бог иногда бывает "на стороне" безбожников