"Царь Иоанн III (т.е. дедушка Иоанна IV) ... прославлен как московский местночтимый святой правоверный царь" - было бы неплохо, да только сомнительно. Где можно узнать об этом понадежней?

"...таинство помазания на царство имеет не магическое, а сакральное значение" - ну да. Я это и имею в виду. Таинство не лишает человека свободы и ответственности.

"Причиной смуты при царе Борисе Годунове всё же стал Лжедмитрий" - причины всегда многообразны, одной нельзя всё объяснить, но всё же очень важная причина - нравственная дезориентация русских людей всех сословий. Мать царевича Димитрия признаёт самозванца своим сыном, множество людей служат очевидным ворам, - чего ж еще наглядней этого?

"Царь (Борис Годунов) лишился чувств и вскоре умер (без покаяния). Так Бог наказал человека, преступившего заповедь "не прикасайтесь к помазанным моим" (я имею ввиду убийство святого царевича Димитрия Угличского)." - Ин суд человечь, ин суд Божий, и наказание здесь, кара или милость - мы не знаем. К тому же заповедь касается именно монархов, а не наследников. Строго говоря, статус царевича Димитрия, как рожденного не от законного первого, второго или третьего брака, вполне мог бы оспариваться, если бы не случилось его смерти. Царь Иоанн IV, кстати, в связи со своими незаконными браками был отлучен от церковного причастия.
Кроме того, версия о виновности Бориса Годунова в убийстве царевича Димитрия - всего лишь версия, к тому же маловероятная. Скорей Шуйские могли быть причастны. Возможно, Годунова хотели подставить, бросить на него тень, подобно истории с Гонгадзе и Кучмой (простите за столь низменное сравнение).

"...обвинять Иоанна IV в смуте, это всё равно что обвинять Петра I в революции или Иосифа Сталина в "перестройке"..." - а что, вполне работающие примеры Вы приводите. И Петра много раз винили в Революции, и уж тем более Сталина - в том, чем Советская власть закончилась. Я вовсе не собираюсь всё упрощать и сводить всё к какой-то одной схеме, но связи прослеживаются. И уж тем более греховность падшего человечества вполне здесь к месту помянуть. Только началось всё не с Адама, а с Евы, если не трогать еще и падших духов.