Мне вообще не очень понятно, почему проблема сильных региональных центров обязательно рассматривается в связи с федеративностью/конфедеративностью. Сильные опорные (или вот богатое слово - реперные):-) центры должны существовать, но они могут существовать не то что в конфедеративном или федеративном, но даже и в унитарном варианте государства. Самонадеянно полагаю, что это настолько очевидно. что даже не требует обсуждений. Сильные центры нужны именно для связности территории (кажется. в теории геополитики есть такой термин), а не ее распада.

Любая прочная структура - это непременно сетка. Сетка - это непременно ее узлы. Если генерировать/моделировать применительно к государству, то в этом случае сетка - радиальная. Москва - центр безусловный. Но узлы сетки - сильные региональные центры. Но НЕ самостоятельные.

А разговор почему-то идет именно не о сильных центрах, а о центрах, как зародышах сепаратизма. Это совершенно другая проблема, никак с "силой" не связанная. Сепаратистским может стать и слабый центр. Примеры: Кишинев, Цхинвал и т.п.